旋风除尘器由于它的结构简单，设备费用低，维修容易，因此可作为独立的除尘装置，也可作为其他除尘装置的前处理除尘装置，一般捕集粒径在几十微米以下，旋风除尘器应用的选择：
根据分离烟气极限粒径的大小来选择，排气管越小，分离捕集的尘粒越小。
在一定的烟气速度极限内，烟气速度越大，压力损失就越大，除尘器效率就越高。
根据除尘器串联级数与集尘箱大小和形状，来选取旋风除尘器。
湿式除尘器具有许多优点，在消耗同等能量情况下，除尘器效率比干式除尘器效率高，他可以处理高温，高湿含量的气体及粘性大的粉尘，可同时净化含有有害气体和粉尘的气体，设备结构简单，设备费用低，占地面积小，但是产生有毒废水，需要进一步处理泥浆废水。
旋风除尘器的进气口是形成的旋转气流的关键部件，是能影响到除尘器效率的压力 损失的主要因素，切向的进气的进口面积对除尘器有很大的影响，进气口的面积相对于筒体的筒体断面积小时，进入除尘器的气流切线的速度大，有利于粉尘的分离。
排风管的直径和插入的深度对旋风除尘器的除尘效率影响有很大的关系，排风管直径必须选择一个合适的值，排风管的直径减小，可减小到内旋流的旋转范围，粉尘是不容易从排风管排出的，有利提高除尘的效率，但是同时出风口的速度增加，阻力损失增大;若增大排风管道直径，虽阻力损失可明显的减小，但是由于排风管的圆筒体管太近，容易形成内、外旋流的“短路”现象，使外旋流中部分未被清除的粉尘直接混入排风管中排出，从而能降低除尘的效率。
旋风除尘器捕集下来的粉尘粒径愈小，该除尘器的除尘效率愈高。离心力的大小与粉尘颗粒有关，颗粒愈大，受到离心力愈大。当粉尘的粒径和切向速度愈大， 径向速度和排风管的直径愈小时，除尘效果愈好。气体中的灰分浓度也是影响出口浓度的关键因素。粉尘浓度增大时，粉尘易于凝聚，使较小的尘粒凝聚在一起而被捕集，同时，大颗粒向器壁移动过程中也会将小颗粒挟带至器壁或撞击而被分离。但由于除尘器内向下高速旋转的气流使其顶部的压力下降，部分气流也会挟带细小的尘粒沿外壁旋转向上到达顶部后，沿排气管外壁旋转向下由排气管排出，导致旋风除尘器的除尘效率不可能为100%。
根据除尘效率计算公式η=(1- So/Si)?100%，式中，η--除尘效率;So--出口处的粉尘的流人量，kg/h;Si--进口处的粉尘的流人量，kg/h。
因为旋风除尘器的除尘效率不可能为100%，当进口粉尘流人量增加后，除尘效率虽有提高，排气管排出粉尘的绝对量也会大大增加。所以，要使排放口的粉尘浓度降低，则要降低入口粉尘浓度，可采取多个旋风除尘器串联使用的多级除尘方式，达到减少排放的目的。